Год спустя после триумфа на национальном чемпионате Сэкай Камики и Фумина Хошино принимают приглашение от «Ядзима Трейдинг» посетить уединённый остров. Там должна пройти презентация экспериментальной боевой системы. Прибыв на место, они находят среди гостей знакомые лица: Гянко, Шиа Киджима и Минато Сакай тоже получили приглашение. Юма Косака отказывается ехать, ссылаясь на помощь Мирай Камики в фотосессии, однако вскоре выясняется, что его путь всё равно лежит на тот же остров.

В этот момент в лаборатории Нильса Нильсена происходит сбой. Новые частицы Плавски спонтанно формируют гигантский кристалл, который начинает влиять на весь Ганпла в округе. Модели на острове выходят из-под контроля, и привычный порядок битв рушится. Нарушенная система угрожает распространить хаос на все Ганпла Баттл по миру, если её не остановить.

Бывшим соперникам и товарищам по команде «Трай Файтерс» приходится действовать сообща, чтобы справиться с вышедшей из-под контроля технологией. Им предстоит разобраться в природе кристалла и найти способ нейтрализовать его, пока не стало слишком поздно.