Команда учёных-ниндзя Гатчамен II

Круизный лайнер «Куин Маргарет» затонул. Сосай Икс врезался в него, объявив о своём возвращении. Среди выживших оказалась четырёхлетняя Сэмми, и её забрал Доктор Пандора. Девочку превратили в Джельсадору, нового генерала Галлактора, а синдикат снова начал охоту на военных и научных специалистов. ИСО пришлось возрождать первую линию обороны — Кагаку Ниндзятай.

Всё изменилось. Кондор Дзе пропал без вести, его считают погибшим, и команда не понимает, как действовать дальше. Новое оружие и транспортные средства есть, но растерянность никуда не уходит. Доктор Кодзабуро Намбу добавляет проблем: он приводит в отряд нового G-2 по имени Гетц Ястреб.

Прошло всего два года с момента, когда мир казался восстановленным. Теперь у ИСО снова есть первая линия обороны, но собирать её приходится заново.