Исчезновение Харухи Судзумии

Кён идёт в школу обычным декабрьским утром и замечает, что мир вокруг него слегка разладился. Танигути не помнит вчерашний разговор, потом вообще не приходит на занятия. В классе пустует место Харухи, а вместо неё сидит Рёко Асакура — та самая, что должна была исчезнуть ещё в прошлом учебном году. Она здоровается с Кёном как со старым знакомым.

Дальше хуже. Микуру Асахина смотрит на него с полным непониманием, а Нагато оказывается обычной тихой девочкой из литературного клуба, без всяких сверхспособностей. Бригады SOS не существует, Харухи тут никогда не училась, и никто не помнит, чтобы Кён с ними общался. Только он сам хранит воспоминания о том, чего больше нет.

Кён пытается разобраться, что произошло и куда делась Харухи. Вокруг него — мир, который почти не отличается от прежнего, но в нём не хватает самого главного человека.