Оперативники Эклипс и Люмьер получают новое задание в рамках детского подразделения. Их отправляют на планету, где вспыхивает конфликт между корпорациями и местным сопротивлением. В центре событий оказывается заброшенный исследовательский комплекс, связанный с прошлым самих агентов.

Люмьер приходится действовать в одиночку, когда обстоятельства разлучают пару. Ей предстоит разобраться в хитросплетениях местной политики и выяснить, кто стоит за провокациями. Тем временем Эклипс сталкивается с данными, которые проливают свет на их собственное происхождение и причины, по которым они обладают особыми способностями.

Этот фильм охватывает события, которые в оригинальном сериале занимают вторую сюжетную арку. История закручивается вокруг секретных экспериментов и того, как прошлое возвращается к агентам. Ответы, которые они находят, ставят под сомнение лояльность детского подразделения и его руководства.